为确定三个连锁基因在染色体上的顺序和相对距离所作的一次杂交和一次测交。染色体上两连锁基因距离越远，在它们之间非姊妹染色单体互换的机会就越多，反之就越少，因此可用这两基因间的互换百分数（一般可用它们之间的重组百分数）的大小来表示它们之间距离的远近，而以1％的互换（或重组）定为一个图距，作为连锁基因的距离单位。例如，已知位于玉米一对同源染色体上的控制籽粒有关性状的有3对基因：C（有色）和c（无色），Sh（饱满）和sh（凹陷），WX（非糯）和wx（糯性）。用籽粒有色、饱满、非糯与籽粒无色、凹陷、糯性的两纯系杂交得F1，再用F1与三隐性（无色、凹陷、糯性）个体测交。若仍用c、sh和wx分别代表有关隐性基因，而用“”代表各显性基因，则有关杂交、测交及测交一代结果如下：
由测交一代的表型可推知F1配子的基因型，由测交一代的亲本型和双互换型可推知sh基因位于其他两基因中间，所以有：
单互换Ⅰ（％）=［（98 107）（39 19）］/6033
=4.36（％）
单互换Ⅱ（％）=［（672 662）（39 19）］/6033
=23.07（％）
于是，这三个基因在染色体上的顺序和距离为：
